股东协议是否一定要按<<公司法>>等规定制定?

只要不违反公司法的一些强行性规定，按实际情况作出约定是有效的。

合法有效

要看你们约定的具体内容，公司法里的有些规定是强制性的，如果你们的约定与这部分强制性规定不符，那就无效。也有很多条款不是强制性的，那是可以自行约定的。
你们最好带合同找专业律师看看再分析。

只要不违反法律的强制性规定就协议有效。